产品介绍

    PatternHunter软件是一个通用的同源序列查询工具，主要包含DNA-DNA序列查询匹配、蛋白质-蛋白质查询匹配、转译DNA-蛋白质序列查询、转译DNA-DNA序列查询等功能。
    PatternHunter已经被世界上领先的基因组研究中心公认和使用。

产品特点

    1. 计算速度快。PatternHunter曾被老鼠基因组测序组织(Mouse Genome Sequence Consortium)使用，进行老鼠基因组和人类基因组的比较。整个工作用了20个CPU-天(Nature, 420(6915):520-522. 2002年12月)。在敏感度相等的情况下，使用BLAST软件完成该工作，需要花费20个CPU-年。
    2. 敏感度高。PatternHunter基于multiple optimal spaced seed专利技术，可以同步提高计算的速度和敏感度(见：Bioinformatics, 18(3):440-445. 2002年3月)。PatternHunter软件 的计算速度是Smith-Waterman无遗漏动态编程算法的3000倍，并且保持了Smith-Waterman算法的敏感度(见：GIW, 164-175, 2003 )。
    3. 支持多CPU的计算平台、多操作系统(包括Linux、Windows XP/2000等)。